Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 FXYD2-206ENST00000532119 562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC006967.3-201ENST00000594086 1093 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL121835.2-201ENST00000624253 3502 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 OPRM1-205ENST00000414028 2485 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TIMM21-204ENST00000580087 2524 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
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MKRN3Q13064 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL031594.1-201ENST00000417123 1932 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
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MKRN3Q13064 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
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MKRN3Q13064 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
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MKRN3Q13064 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
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MKRN3Q13064 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
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MKRN3Q13064 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
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