Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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FOXD4Q12950 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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FOXD4Q12950 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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FOXD4Q12950 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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FOXD4Q12950 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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FOXD4Q12950 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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