Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRZ1P23471 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRZ1P23471 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms