Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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PTPRBP23467 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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PTPRBP23467 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
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PTPRBP23467 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
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PTPRBP23467 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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