Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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NDUFA9Q16795 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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NDUFA9Q16795 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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NDUFA9Q16795 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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NDUFA9Q16795 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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NDUFA9Q16795 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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NDUFA9Q16795 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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NDUFA9Q16795 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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NDUFA9Q16795 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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NDUFA9Q16795 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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NDUFA9Q16795 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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NDUFA9Q16795 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NDUFA9Q16795 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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