Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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DDX39BQ13838 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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DDX39BQ13838 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDX39BQ13838 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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