Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms