Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms