Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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