Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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