Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TPD52-213ENST00000520527 2638 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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MKRN3Q13064 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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MKRN3Q13064 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MAPK10-244ENST00000639972 2818 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
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MKRN3Q13064 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RN7SL706P-201ENST00000460079 292 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
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