Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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