Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ITGAEP38570 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms