Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
IMPG1Q17R60 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
IMPG1Q17R60 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IMPG1Q17R60 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IMPG1Q17R60 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IMPG1Q17R60 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IMPG1Q17R60 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
IMPG1Q17R60 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IMPG1Q17R60 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
IMPG1Q17R60 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IMPG1Q17R60 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
IMPG1Q17R60 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IMPG1Q17R60 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IMPG1Q17R60 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IMPG1Q17R60 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IMPG1Q17R60 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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