Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 CALN1-202ENST00000395275 9459 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 C2CD3-202ENST00000334126 7960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 ERCC6-201ENST00000355832 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 ADAMTS4-202ENST00000367996 9773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 FAM199X-202ENST00000493442 7457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RYR3Q15413 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms