Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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COL4A6Q14031 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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COL4A6Q14031 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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