Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FHL3Q13643 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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