Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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SP140Q13342 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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SP140Q13342 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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SP140Q13342 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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SP140Q13342 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SP140Q13342 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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SP140Q13342 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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SP140Q13342 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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