Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms