Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA13P31271 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA13P31271 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA13P31271 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA13P31271 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA13P31271 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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