Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM47Q96LD4 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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