Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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CLIP4Q8N3C7 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLIP4Q8N3C7 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLIP4Q8N3C7 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLIP4Q8N3C7 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLIP4Q8N3C7 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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CLIP4Q8N3C7 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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CLIP4Q8N3C7 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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CLIP4Q8N3C7 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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CLIP4Q8N3C7 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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CLIP4Q8N3C7 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLIP4Q8N3C7 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLIP4Q8N3C7 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLIP4Q8N3C7 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLIP4Q8N3C7 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLIP4Q8N3C7 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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CLIP4Q8N3C7 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLIP4Q8N3C7 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLIP4Q8N3C7 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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CLIP4Q8N3C7 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CLIP4Q8N3C7 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CLIP4Q8N3C7 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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