Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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ECM1Q16610 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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ECM1Q16610 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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ECM1Q16610 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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ECM1Q16610 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.33
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ECM1Q16610 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ECM1Q16610 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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