Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms