Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
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