Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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COL4A6Q14031 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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COL4A6Q14031 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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COL4A6Q14031 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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COL4A6Q14031 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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COL4A6Q14031 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
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COL4A6Q14031 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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