Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ALCAMQ13740 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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