Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms