Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK2Q13002 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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