Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PDE4DQ08499 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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PDE4DQ08499 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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PDE4DQ08499 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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PDE4DQ08499 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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PDE4DQ08499 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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PDE4DQ08499 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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PDE4DQ08499 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDE4DQ08499 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDE4DQ08499 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDE4DQ08499 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDE4DQ08499 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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