Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TM6SF1Q9BZW5 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms