Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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