Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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COL4A6Q14031 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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COL4A6Q14031 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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COL4A6Q14031 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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COL4A6Q14031 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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COL4A6Q14031 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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COL4A6Q14031 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL4A6Q14031 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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COL4A6Q14031 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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COL4A6Q14031 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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COL4A6Q14031 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL4A6Q14031 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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