Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PICALMQ13492 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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