Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 GABRB3-225ENST00000638099 2752 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 DIAPH3-203ENST00000400319 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 ERC1-213ENST00000543086 9241 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 NRG3-206ENST00000545131 2713 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 BRDT-204ENST00000394530 3207 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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FOXC1Q12948 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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FOXC1Q12948 DAZ2-207ENST00000382449 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 CEP41-219ENST00000616628 3315 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 MEP1B-201ENST00000269202 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 GC-201ENST00000273951 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 FAXDC2-201ENST00000326080 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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