Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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