Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMPD1P17405 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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