Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GTF3C6Q969F1 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms