Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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COL24A1Q17RW2 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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COL24A1Q17RW2 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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COL24A1Q17RW2 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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COL24A1Q17RW2 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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COL24A1Q17RW2 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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COL24A1Q17RW2 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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