Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SP140Q13342 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SP140Q13342 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SP140Q13342 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SP140Q13342 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SP140Q13342 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SP140Q13342 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SP140Q13342 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SP140Q13342 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SP140Q13342 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SP140Q13342 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SP140Q13342 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SP140Q13342 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SP140Q13342 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SP140Q13342 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SP140Q13342 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SP140Q13342 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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SP140Q13342 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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SP140Q13342 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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SP140Q13342 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SP140Q13342 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SP140Q13342 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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