Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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