Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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PTPN13Q12923 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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PTPN13Q12923 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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PTPN13Q12923 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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PTPN13Q12923 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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PTPN13Q12923 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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PTPN13Q12923 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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