Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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