Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TTPAP49638 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TTPAP49638 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TTPAP49638 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TTPAP49638 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TTPAP49638 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TTPAP49638 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TTPAP49638 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TTPAP49638 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TTPAP49638 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TTPAP49638 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
TTPAP49638 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTPAP49638 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms