Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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PTPRBP23467 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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PTPRBP23467 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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PTPRBP23467 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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PTPRBP23467 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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PTPRBP23467 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
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PTPRBP23467 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
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PTPRBP23467 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
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PTPRBP23467 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.77
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PTPRBP23467 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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PTPRBP23467 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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PTPRBP23467 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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PTPRBP23467 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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PTPRBP23467 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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