Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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PTPRCP08575 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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