Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms