Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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