Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC138207.6-201ENST00000579164 1967 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 PMS2CL-204ENST00000486256 3327 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 AL355103.1-201ENST00000557246 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TRHP20396 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 C18orf32-203ENST00000613385 5395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 FRMPD2-213ENST00000636244 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 NIM1K-204ENST00000512796 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 GLDN-202ENST00000396399 4584 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 TNFAIP8-206ENST00000504771 8681 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 STARD4-212ENST00000512160 3500 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 SMC1B-202ENST00000404354 3636 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 ADH4-201ENST00000265512 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TRHP20396 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 LDAH-208ENST00000435420 3837 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 DHX8-202ENST00000540306 3809 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 MED23-202ENST00000368053 2811 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 SOSTDC1-202ENST00000396652 2411 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 EGF-204ENST00000503392 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 MEF2C-222ENST00000514028 3393 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TRHP20396 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms