Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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